Vào tháng 7 năm 2009, khi biến cố Tam Tòa bùng nổ, là lúc ngài đặt chân đến phi trường New York, và cuộc hành trình của ngài dự trù sẽ dừng chân tại Miền Bắc Cali. Nhiều cuộc tiếp xúc các giám mục Mỹ tại địa phương được sắp xếp, nhưng biến cố dồn dập, ngài đã gạt nước mắt để vội vã trở về Việt Nam.
Trong một cuộc điện đàm với vài anh em trong Hội, Đức cha nói trong nỗi nghẹn ngào, “Tôi mong muốn đến với anh em mà Chúa không muốn!” Nhưng chính nhờ cuộc trở về đúng lúc trong những ngày đó, Giáo phận Vinh đã có những cuộc diễn hành đức tin, có lúc cả hai trăm ngàn giáo dân tham dự, nói lên sự đoàn kết keo sơn, qua câu nói của ngài: “Giáo phận Vinh không chỉ có một mà có đến 500.000 Cao Đình Thuyên!” Cuộc đàn áp có đổ máu đó, vì thế, đã sớm dừng lại.